由于過去香港聯合交易所具有較大的一線監(jiān)管權力，因此擔心合并后其一線監(jiān)管權被收回，這也是這次交易所合并的主要障礙之一。經過證監(jiān)會與聯合交易所充分協(xié)商，最后對監(jiān)管權的劃分如下：

(1)交易所內市場監(jiān)察

新的體制基本維持過去的分工。即：香港交易所作為商業(yè)機構著重負責市場交易活動的監(jiān)察和風險管理，包括：執(zhí)行交易和結算規(guī)則、監(jiān)察市場參與者的違規(guī)行為；實時監(jiān)察價格和成交額的走勢、要求公司即時披露價格敏感信息、保持市場透明度；監(jiān)察異常集中持倉情況和反常的價格交易波動、協(xié)助證監(jiān)會進行風險管理；處理交易糾紛；跨市場監(jiān)管香港交易所的客戶。

證監(jiān)會將主要負責監(jiān)察可能觸犯法律的違規(guī)行為，包括：監(jiān)察可能觸犯證券期貨法規(guī)行為；調查涉嫌違法行為；監(jiān)督香港交易所進行的監(jiān)管活動；監(jiān)察跨市場交易活動。

(2)對中介機構的監(jiān)管

過去由聯合交易所履行的審慎管理其會員的職責，轉到證監(jiān)會執(zhí)行。但新的交易所仍保留了監(jiān)察中介機構某些具體業(yè)務的職責，如對會員公司進行業(yè)務例行檢查、監(jiān)督會員遵守交易操守準則、確保會員設有適當的管理和風險監(jiān)控體系等。證監(jiān)會同事保留了對上述事項共同監(jiān)管的責任，必要時可對上市監(jiān)管事項發(fā)表意見。

(3)上市公司的監(jiān)管

在對上市公司的監(jiān)管方面，基本上保持了原有的職責分工。